Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms