Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN4Q92575 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms