Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC3Q8TF64 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms