Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP1Q8TDR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms