Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3R3

TCAIM, T-cell activation inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAIMQ8N3R3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAIMQ8N3R3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAIMQ8N3R3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAIMQ8N3R3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAIMQ8N3R3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms