Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00299Q6ZSB3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00299Q6ZSB3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms