Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BLOC1S3Q6QNY0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms