Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms