Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CREB3L3Q68CJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREB3L3Q68CJ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 555.2 ms