Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CEP170Q5SW79 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.94
CEP170Q5SW79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CEP170Q5SW79 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CEP170Q5SW79 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CEP170Q5SW79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
CEP170Q5SW79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms