Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSX1Q16384 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSX1Q16384 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSX1Q16384 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSX1Q16384 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX1Q16384 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSX1Q16384 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX1Q16384 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX1Q16384 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX1Q16384 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX1Q16384 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX1Q16384 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX1Q16384 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX1Q16384 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX1Q16384 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX1Q16384 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX1Q16384 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX1Q16384 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX1Q16384 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX1Q16384 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX1Q16384 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX1Q16384 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX1Q16384 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX1Q16384 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX1Q16384 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSX1Q16384 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX1Q16384 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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