Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB30Q15771 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB30Q15771 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
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RAB30Q15771 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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RAB30Q15771 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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RAB30Q15771 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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