Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC1Q15751 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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