Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL28Q13084 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL28Q13084 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL28Q13084 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL28Q13084 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL28Q13084 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL28Q13084 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL28Q13084 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL28Q13084 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL28Q13084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL28Q13084 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL28Q13084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL28Q13084 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL28Q13084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL28Q13084 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL28Q13084 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL28Q13084 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL28Q13084 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL28Q13084 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL28Q13084 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL28Q13084 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL28Q13084 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL28Q13084 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL28Q13084 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL28Q13084 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRPL28Q13084 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL28Q13084 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL28Q13084 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL28Q13084 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL28Q13084 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL28Q13084 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL28Q13084 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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