Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCRN1Q12765 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28■■■□□ 2.07
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SCRN1Q12765 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCRN1Q12765 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
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