Protein–RNA interactions for Protein: Q12348

RRI2, COP9 signalosome complex subunit 10, yeastyeast

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI2Q12348 GYP8YFL027C 1494 nt7.21□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 PDR18YNR070W 4002 nt7.21□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 MNS1YJR131W 1650 nt7.2□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 UTP4YDR324C 2331 nt7.2□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.2□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 TMT1YER175C 900 nt7.2□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YPL102CYPL102C 303 nt7.2□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 SES1YDR023W 1389 nt7.2□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YCK1YHR135C 1617 nt7.19□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 GEF1YJR040W 2340 nt7.19□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YLR126CYLR126C 756 nt7.19□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 MRPS16YPL013C 366 nt7.19□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 MDM31YHR194W 1740 nt7.18□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 RQC1YDR333C 2172 nt7.18□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 PRS2YER099C 957 nt7.18□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 ADE12YNL220W 1302 nt7.18□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 ARP3YJR065C 1350 nt7.18□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YEL068CYEL068C 333 nt7.17□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 DMA1YHR115C 1251 nt7.17□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 EGD2YHR193C 525 nt7.17□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 SUR7YML052W 909 nt7.17□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 MSN2YMR037C 2115 nt7.17□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 SHP1YBL058W 1272 nt7.17□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 HRQ1YDR291W 3234 nt7.16□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 HSP12YFL014W 330 nt7.16□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YJL211CYJL211C 444 nt7.16□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt7.16□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YBL070CYBL070C 321 nt7.16□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 WHI2YOR043W 1461 nt7.16□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 DRS1YLL008W 2259 nt7.16□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 DEF1YKL054C 2217 nt7.15□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.15□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 TSA1YML028W 591 nt7.15□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 RPL21AYBR191W 483 nt7.15□□□□□ -1.26
RRI2Q12348 TRR1YDR353W 960 nt7.14□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 LEU5YHR002W 1074 nt7.14□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 ASK1YKL052C 879 nt7.14□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 PGM1YKL127W 1713 nt7.14□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 YTP1YNL237W 1380 nt7.14□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 AFG2YLR397C 2343 nt7.13□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 BDF2YDL070W 1917 nt7.13□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 PRI2YKL045W 1587 nt7.13□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 DFM1YDR411C 1026 nt7.13□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 LAG2YOL025W 1983 nt7.13□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 YDL172CYDL172C 480 nt7.12□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 SYF2YGR129W 648 nt7.12□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.12□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 HSM3YBR272C 1443 nt7.11□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 UGX2YDL169C 672 nt7.11□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 BNS1YGR230W 414 nt7.11□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 SMK1YPR054W 1167 nt7.11□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 YPR114WYPR114W 948 nt7.11□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 MRPS5YBR251W 924 nt7.11□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 MSB3YNL293W 1902 nt7.11□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 IES1YFL013C 2079 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 CRP1YHR146W 1398 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 ISN1YOR155C 1353 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 COX20YDR231C 618 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 ERP5YHR110W 639 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 SPO7YAL009W 780 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 HMS2YJR147W 1077 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 BSC4YNL269W 396 nt7.1□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 NPL6YMR091C 1308 nt7.09□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 IRS4YKR019C 1848 nt7.09□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 CIN4YMR138W 576 nt7.09□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 KNS1YLL019C 2214 nt7.09□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 ECM38YLR299W 1983 nt7.09□□□□□ -1.27
RRI2Q12348 RAD24YER173W 1980 nt7.08□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 PYK2YOR347C 1521 nt7.08□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YDL023CYDL023C 321 nt7.08□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 GTT3YEL017W 1014 nt7.08□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 CSL4YNL232W 879 nt7.08□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 TFB4YPR056W 1017 nt7.08□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 TOS2YGR221C 1869 nt7.08□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 MTF2YDL044C 1323 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 ARG81YML099C 2643 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 GUD1YDL238C 1470 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YML012C-AYML012C-A 378 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YMR027WYMR027W 1413 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 PXL1YKR090W 2121 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 COR1YBL045C 1374 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 EEB1YPL095C 1371 nt7.07□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YDR278CYDR278C 318 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YGL235WYGL235W 537 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 BCY1YIL033C 1251 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 RRN10YBL025W 438 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YHM2YMR241W 945 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 DAP1YPL170W 459 nt7.06□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 VPS61YDR136C 573 nt7.05□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.05□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 COA1YIL157C 594 nt7.05□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.05□□□□□ -1.28
RRI2Q12348 HAP3YBL021C 435 nt7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.9 ms