Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt9.21□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt9.21□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt9.21□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt9.21□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 BSC4YNL269W 396 nt9.21□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 SRF1YDL133W 1314 nt9.2□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 VMA16YHR026W 642 nt9.2□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 CAR1YPL111W 1002 nt9.2□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 OPI8YKR035C 642 nt9.19□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 YHM2YMR241W 945 nt9.19□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 NUD1YOR373W 2556 nt9.18□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 GAL2YLR081W 1725 nt9.17□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 YLR194CYLR194C 765 nt9.17□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 HSP26YBR072W 645 nt9.17□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 ECM27YJR106W 2178 nt9.16□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 KIN1YDR122W 3195 nt9.16□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 PAN6YIL145C 930 nt9.15□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 DJP1YIR004W 1299 nt9.15□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 YJR015WYJR015W 1533 nt9.15□□□□□ -0.94
SMC4Q12267 VPS61YDR136C 573 nt9.14□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 AMD1YML035C 2433 nt9.14□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 PGM1YKL127W 1713 nt9.14□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 BCY1YIL033C 1251 nt9.14□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 MRPL36YBR122C 534 nt9.14□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 APE3YBR286W 1614 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 YLR173WYLR173W 1827 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 SES1YDR023W 1389 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 EFM1YHL039W 1758 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 ADE13YLR359W 1449 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 ARR3YPR201W 1215 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 ERG3YLR056W 1098 nt9.12□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 YBR144CYBR144C 315 nt9.12□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 YFL064CYFL064C 525 nt9.1□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 YPR202WYPR202W 717 nt9.1□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 RTG2YGL252C 1767 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 SOG2YOR353C 2376 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 COX5AYNL052W 462 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC4Q12267 RPS9AYPL081W 594 nt9.08□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 ORC5YNL261W 1440 nt9.08□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 KKQ8YKL168C 2175 nt9.07□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 MLC1YGL106W 450 nt9.07□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 ILV2YMR108W 2064 nt9.07□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 YMR155WYMR155W 1644 nt9.07□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 COA1YIL157C 594 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 SKG1YKR100C 1068 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 DPH5YLR172C 903 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 SEC23YPR181C 2307 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 GIT1YCR098C 1557 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 GAA1YLR088W 1845 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 RRP45YDR280W 918 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 SPT3YDR392W 1014 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 ATO2YNR002C 849 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 SHM1YBR263W 1473 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 ERI1YPL096C-A 207 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 TEP1YNL128W 1305 nt9.04□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 APS3YJL024C 585 nt9.04□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 YDR109CYDR109C 2148 nt9.03□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 SEC20YDR498C 1152 nt9.03□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 PRO3YER023W 861 nt9.03□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 YBR124WYBR124W 360 nt9.03□□□□□ -0.96
SMC4Q12267 RPT3YDR394W 1287 nt9.02□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 GLN1YPR035W 1113 nt9.02□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 HSM3YBR272C 1443 nt9□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 GYP8YFL027C 1494 nt8.99□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 CRP1YHR146W 1398 nt8.99□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 VRP1YLR337C 2454 nt8.99□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 CSG2YBR036C 1233 nt8.99□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 GIR2YDR152W 798 nt8.98□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 YOR342CYOR342C 960 nt8.98□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 RQC1YDR333C 2172 nt8.98□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 HSX1tR(CCU)J 72 nt8.97□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 YCL041CYCL041C 495 nt8.97□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 FRT1YOR324C 1809 nt8.97□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 YCL065WYCL065W 369 nt8.97□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 YDR154CYDR154C 351 nt8.97□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 GLE1YDL207W 1617 nt8.96□□□□□ -0.97
SMC4Q12267 SUP19tS(UGA)E 82 nt8.96□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 SUP17tS(UGA)I 82 nt8.96□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 SUP16tS(UGA)P 82 nt8.96□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 PGU1YJR153W 1086 nt8.96□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 CTF3YLR381W 2202 nt8.95□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 RRN10YBL025W 438 nt8.95□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 PYC2YBR218C 3543 nt8.94□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 FRS2YFL022C 1512 nt8.94□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YAP1801YHR161C 1914 nt8.94□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 QNS1YHR074W 2145 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 PET112YBL080C 1626 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YDL034WYDL034W 345 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 PPS1YBR276C 2424 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YRA1YDR381W 681 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 DMA1YHR115C 1251 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YKL151CYKL151C 1014 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YNL019CYNL019C 855 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 YNL033WYNL033W 855 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 HSP12YFL014W 330 nt8.91□□□□□ -0.98
SMC4Q12267 CAD1YDR423C 1230 nt8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 103 ms