Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 IVY1YDR229W 1362 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 HXT15YDL245C 1704 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 HXT16YJR158W 1704 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YBR284WYBR284W 2394 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 TIM22YDL217C 624 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 ICL1YER065C 1674 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YTP1YNL237W 1380 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 NHA1YLR138W 2958 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 PGM1YKL127W 1713 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 RIO1YOR119C 1455 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YIR042CYIR042C 711 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 PEX13YLR191W 1161 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 AIM33YML087C 939 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 JNM1YMR294W 1122 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 CAF40YNL288W 1122 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YFL052WYFL052W 1398 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 SPS22YCL048W 1392 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 RAP1YNL216W 2484 nt6.4□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 FRE5YOR384W 2085 nt6.4□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 ELP3YPL086C 1674 nt6.4□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 RRS1YOR294W 612 nt6.4□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 CRP1YHR146W 1398 nt6.4□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 YCK1YHR135C 1617 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 BUD32YGR262C 786 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 RPS5YJR123W 678 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 NMT1YLR195C 1368 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 CMR1YDL156W 1569 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 CYC8YBR112C 2901 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 PYC2YBR218C 3543 nt6.38□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 COA1YIL157C 594 nt6.38□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 BSC4YNL269W 396 nt6.38□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 RPL21AYBR191W 483 nt6.38□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 MDM31YHR194W 1740 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 CDC34YDR054C 888 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 DMA1YHR115C 1251 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 ERP2YAL007C 648 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 LDS1YAL018C 978 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 GCV3YAL044C 513 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 UTP4YDR324C 2331 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 GEF1YJR040W 2340 nt6.36□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 SKI2YLR398C 3864 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 VPS61YDR136C 573 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 CDC11YJR076C 1248 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 UIP4YPL186C 915 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 SKS1YPL026C 1509 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 WHI2YOR043W 1461 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 ACS1YAL054C 2142 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 ECM19YLR390W 339 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 ATG17YLR423C 1254 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 GUF1YLR289W 1938 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 EFT2YDR385W 2529 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 EFT1YOR133W 2529 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS54Q12071 POP1YNL221C 2628 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 snR82snR82 268 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 ENV7YPL236C 1095 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 LAG2YOL025W 1983 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 RSC2YLR357W 2670 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 SIT4YDL047W 936 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YGL235WYGL235W 537 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 TSA1YML028W 591 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 MRPS16YPL013C 366 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 HXT17YNR072W 1695 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YDR278CYDR278C 318 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YEL068CYEL068C 333 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YGR127WYGR127W 939 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 TIF2YJL138C 1188 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 TIF1YKR059W 1188 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 SLX5YDL013W 1860 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 TFC6YDR362C 2019 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 IRS4YKR019C 1848 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 GUD1YDL238C 1470 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 MSN2YMR037C 2115 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YPL102CYPL102C 303 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 DAP1YPL170W 459 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 MNS1YJR131W 1650 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YDR401WYDR401W 564 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 ORM1YGR038W 669 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 DUS4YLR405W 1104 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YML133CYML133C 4125 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 HST2YPL015C 1074 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 YPR114WYPR114W 948 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 GPA2YER020W 1350 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 PAP2YOL115W 1755 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 ADE12YNL220W 1302 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 OPT1YJL212C 2400 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 MSS1YMR023C 1581 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 CIN4YMR138W 576 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 NTE1YML059C 5040 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS54Q12071 HST3YOR025W 1344 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 YDL129WYDL129W 876 nt6.27□□□□□ -1.41
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