Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 UIP5YKR044W 1332 nt5.22□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 GUF1YLR289W 1938 nt5.21□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 ERG7YHR072W 2196 nt5.21□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YGL235WYGL235W 537 nt5.21□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 COA1YIL157C 594 nt5.21□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 UBA1YKL210W 3075 nt5.21□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 ECM3YOR092W 1842 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YDR514CYDR514C 1452 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 CIT3YPR001W 1461 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 ROG3YFR022W 2202 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 GPA2YER020W 1350 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 MSN2YMR037C 2115 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 ZWF1YNL241C 1518 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 IMG1YCR046C 510 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 COX9YDL067C 180 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 CDC11YJR076C 1248 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YJR084WYJR084W 1272 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 RDL2YOR286W 450 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 GPD2YOL059W 1323 nt5.2□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 CST6YIL036W 1764 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 OXP1YKL215C 3861 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 STB5YHR178W 2232 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 MRS1YIR021W 1092 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 FPR3YML074C 1236 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 ARA2YMR041C 1008 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YPR123CYPR123C 435 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 SUE1YPR151C 621 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 ILV6YCL009C 930 nt5.19□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 MKK2YPL140C 1521 nt5.18□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 IVY1YDR229W 1362 nt5.18□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YKR045CYKR045C 552 nt5.18□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 RPS3YNL178W 723 nt5.18□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 ODC2YOR222W 924 nt5.18□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YBR027CYBR027C 333 nt5.18□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YDR278CYDR278C 318 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 AAT2YLR027C 1257 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 TSR2YLR435W 618 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 RPS28AYOR167C 204 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 VPS70YJR126C 2436 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 RSC2YLR357W 2670 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 ILV1YER086W 1731 nt5.17□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YFL052WYFL052W 1398 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 VTH1YIL173W 4650 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 VTH2YJL222W 4650 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 BUG1YDL099W 1026 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YIR042CYIR042C 711 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YLR296WYLR296W 327 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 SCS7YMR272C 1155 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 IFA38YBR159W 1044 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 YLL067CYLL067C 3618 nt5.16□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 AMD2YDR242W 1650 nt5.15□□□□□ -1.58
HRD1Q08109 PGK1YCR012W 1251 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 RAD59YDL059C 717 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 TMT1YER175C 900 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 NPA3YJR072C 1158 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 ICT1YLR099C 1185 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 YOL163WYOL163W 510 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 VPS1YKR001C 2115 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 NHA1YLR138W 2958 nt5.15□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 AMA1YGR225W 1782 nt5.14□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 PTK2YJR059W 2457 nt5.14□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 YDR396WYDR396W 501 nt5.14□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 RRP46YGR095C 672 nt5.14□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 BCY1YIL033C 1251 nt5.14□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 ACC1YNR016C 6702 nt5.14□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CMR1YDL156W 1569 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 YHL017WYHL017W 1599 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 PFK2YMR205C 2880 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 RPT3YDR394W 1287 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 SOH1YGL127C 384 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CLP1YOR250C 1338 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 SPS22YCL048W 1392 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 TAH18YPR048W 1872 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 MCH1YDL054C 1461 nt5.13□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 PET112YBL080C 1626 nt5.12□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 DBP9YLR276C 1785 nt5.12□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 TSR3YOR006C 942 nt5.12□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CHS5YLR330W 2016 nt5.12□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 ALD6YPL061W 1503 nt5.12□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 MRC1YCL061C 3291 nt5.12□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 MNN5YJL186W 1761 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CUP2YGL166W 678 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 GLC8YMR311C 690 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 YNL017CYNL017C 339 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 YNL108CYNL108C 813 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 MRPL10YNL284C 969 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 MRPS12YNR036C 462 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 GLN1YPR035W 1113 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 RPN7YPR108W 1290 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 PRP24YMR268C 1335 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CHL4YDR254W 1377 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 PYK2YOR347C 1521 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 PYC2YBR218C 3543 nt5.11□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CRF1YDR223W 1404 nt5.1□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 RRS1YOR294W 612 nt5.1□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CLB2YPR119W 1476 nt5.1□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 SGF29YCL010C 780 nt5.1□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 CDC16YKL022C 2523 nt5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.3 ms