Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FMODQ06828 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FMODQ06828 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FMODQ06828 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FMODQ06828 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FMODQ06828 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FMODQ06828 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FMODQ06828 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FMODQ06828 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FMODQ06828 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FMODQ06828 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FMODQ06828 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FMODQ06828 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FMODQ06828 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FMODQ06828 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FMODQ06828 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FMODQ06828 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FMODQ06828 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FMODQ06828 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FMODQ06828 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FMODQ06828 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FMODQ06828 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FMODQ06828 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FMODQ06828 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FMODQ06828 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FMODQ06828 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FMODQ06828 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FMODQ06828 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FMODQ06828 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FMODQ06828 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FMODQ06828 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FMODQ06828 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FMODQ06828 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FMODQ06828 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FMODQ06828 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FMODQ06828 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FMODQ06828 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FMODQ06828 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FMODQ06828 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FMODQ06828 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FMODQ06828 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FMODQ06828 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FMODQ06828 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FMODQ06828 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FMODQ06828 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms