Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPB1Q06547 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABPB1Q06547 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms