Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKCDQ05655 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms