Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTK2Q05397 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTK2Q05397 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms