Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF85Q03923 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF85Q03923 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms