Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 LYS21YDL131W 1323 nt5.92□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 HST3YOR025W 1344 nt5.92□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 YCK1YHR135C 1617 nt5.92□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 TMT1YER175C 900 nt5.91□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 YHM2YMR241W 945 nt5.91□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 UIP4YPL186C 915 nt5.91□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 FET4YMR319C 1659 nt5.91□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 CYC8YBR112C 2901 nt5.9□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 PRI2YKL045W 1587 nt5.9□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 LEU5YHR002W 1074 nt5.9□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 CIN4YMR138W 576 nt5.9□□□□□ -1.46
CCE1Q03702 MDM31YHR194W 1740 nt5.89□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 CDC34YDR054C 888 nt5.89□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 MRPL1YDR116C 858 nt5.89□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 QCR6YFR033C 444 nt5.89□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YNL165WYNL165W 1221 nt5.89□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 RPN7YPR108W 1290 nt5.89□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YPR204WYPR204W 3099 nt5.89□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 RPT3YDR394W 1287 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YGR139WYGR139W 339 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 MRPS12YNR036C 462 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 GLN1YPR035W 1113 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YPR114WYPR114W 948 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 MRPS5YBR251W 924 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 GLN3YER040W 2193 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 CIT3YPR001W 1461 nt5.88□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 SEN34YAR008W 828 nt5.87□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 MOD5YOR274W 1287 nt5.87□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 IFA38YBR159W 1044 nt5.87□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 ADE12YNL220W 1302 nt5.87□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 COA1YIL157C 594 nt5.86□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 HMS2YJR147W 1077 nt5.86□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 ECM19YLR390W 339 nt5.86□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.86□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 AVT4YNL101W 2142 nt5.86□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 PYK2YOR347C 1521 nt5.85□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 GYP8YFL027C 1494 nt5.85□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YIR042CYIR042C 711 nt5.85□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 PXL1YKR090W 2121 nt5.85□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YLR126CYLR126C 756 nt5.85□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.85□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 RAD24YER173W 1980 nt5.84□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 SNU71YGR013W 1863 nt5.84□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 DUS4YLR405W 1104 nt5.84□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 SHP1YBL058W 1272 nt5.84□□□□□ -1.47
CCE1Q03702 GUD1YDL238C 1470 nt5.83□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 TPO3YPR156C 1869 nt5.83□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 YTP1YNL237W 1380 nt5.83□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 PHO3YBR092C 1404 nt5.82□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 NMT1YLR195C 1368 nt5.82□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 UGX2YDL169C 672 nt5.82□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 TPK1YJL164C 1194 nt5.82□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 ATG4YNL223W 1485 nt5.82□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 KKQ8YKL168C 2175 nt5.82□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 HXT2YMR011W 1626 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 YDR278CYDR278C 318 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 PRS2YER099C 957 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 LCP5YER127W 1074 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 ERP2YAL007C 648 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 ASK1YKL052C 879 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 REC114YMR133W 1287 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 YNL017CYNL017C 339 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 YOR200WYOR200W 399 nt5.81□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 TEP1YNL128W 1305 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 MNS1YJR131W 1650 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 COX20YDR231C 618 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 DFM1YDR411C 1026 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 FPR2YDR519W 408 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 ICS3YJL077C 396 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 ATG17YLR423C 1254 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 YBL070CYBL070C 321 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 YOL163WYOL163W 510 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 PET112YBL080C 1626 nt5.8□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 ARG81YML099C 2643 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 AFG1YEL052W 1530 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 SHO1YER118C 1104 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 MRS1YIR021W 1092 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 JIP4YDR475C 2631 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 PYC2YBR218C 3543 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 EFT2YDR385W 2529 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 EFT1YOR133W 2529 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 GPA2YER020W 1350 nt5.79□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.78□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.78□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.78□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.78□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.78□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 EGD2YHR193C 525 nt5.78□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 AAD15YOL165C 432 nt5.78□□□□□ -1.48
CCE1Q03702 PGK1YCR012W 1251 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 GPI11YDR302W 660 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 IRC7YFR055W 1023 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 YNL200CYNL200C 741 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 YNR040WYNR040W 771 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18 ms