Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms