Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPL7AP62424 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL7AP62424 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL7AP62424 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms