Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3AP57075 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms