Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP12AP54707 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms