Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 SCS7YMR272C 1155 nt5.42□□□□□ -1.54
UFD1P53044 YIR007WYIR007W 2295 nt5.41□□□□□ -1.54
UFD1P53044 YDR278CYDR278C 318 nt5.41□□□□□ -1.54
UFD1P53044 YLR184WYLR184W 348 nt5.41□□□□□ -1.54
UFD1P53044 MCM6YGL201C 3054 nt5.41□□□□□ -1.54
UFD1P53044 PTC3YBL056W 1407 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 PPT1YGR123C 1542 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 PYK2YOR347C 1521 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 IRS4YKR019C 1848 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 GAL83YER027C 1254 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 COA1YIL157C 594 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 RPL21AYBR191W 483 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 SGF29YCL010C 780 nt5.4□□□□□ -1.54
UFD1P53044 UIP5YKR044W 1332 nt5.4□□□□□ -1.55
UFD1P53044 PRP24YMR268C 1335 nt5.4□□□□□ -1.55
UFD1P53044 VBA1YMR088C 1689 nt5.4□□□□□ -1.55
UFD1P53044 ZWF1YNL241C 1518 nt5.39□□□□□ -1.55
UFD1P53044 POP5YAL033W 522 nt5.39□□□□□ -1.55
UFD1P53044 AMD2YDR242W 1650 nt5.39□□□□□ -1.55
UFD1P53044 IVY1YDR229W 1362 nt5.39□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YHL017WYHL017W 1599 nt5.38□□□□□ -1.55
UFD1P53044 CST6YIL036W 1764 nt5.38□□□□□ -1.55
UFD1P53044 DRE2YKR071C 1047 nt5.38□□□□□ -1.55
UFD1P53044 FPR3YML074C 1236 nt5.38□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YBR027CYBR027C 333 nt5.38□□□□□ -1.55
UFD1P53044 GUP2YPL189W 1830 nt5.38□□□□□ -1.55
UFD1P53044 NSE5YML023C 1671 nt5.37□□□□□ -1.55
UFD1P53044 VPS5YOR069W 2028 nt5.37□□□□□ -1.55
UFD1P53044 MDH1YKL085W 1005 nt5.37□□□□□ -1.55
UFD1P53044 ROG3YFR022W 2202 nt5.37□□□□□ -1.55
UFD1P53044 STB5YHR178W 2232 nt5.37□□□□□ -1.55
UFD1P53044 GPA2YER020W 1350 nt5.37□□□□□ -1.55
UFD1P53044 ASN1YPR145W 1719 nt5.37□□□□□ -1.55
UFD1P53044 PYC2YBR218C 3543 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 PGK1YCR012W 1251 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 BUG1YDL099W 1026 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 TMT1YER175C 900 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YMR122CYMR122C 375 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 ATP4YPL078C 735 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YMC1YPR058W 924 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 OXP1YKL215C 3861 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 MKK2YPL140C 1521 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 HRQ1YDR291W 3234 nt5.36□□□□□ -1.55
UFD1P53044 ERG7YHR072W 2196 nt5.35□□□□□ -1.55
UFD1P53044 CUP2YGL166W 678 nt5.35□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YIR042CYIR042C 711 nt5.35□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YMR252CYMR252C 405 nt5.35□□□□□ -1.55
UFD1P53044 MRC1YCL061C 3291 nt5.35□□□□□ -1.55
UFD1P53044 CLB2YPR119W 1476 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YJR084WYJR084W 1272 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YML083CYML083C 1257 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 RPS3YNL178W 723 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 MRPS12YNR036C 462 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YBL112CYBL112C 318 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 YOL163WYOL163W 510 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 ECM3YOR092W 1842 nt5.34□□□□□ -1.55
UFD1P53044 AMA1YGR225W 1782 nt5.34□□□□□ -1.56
UFD1P53044 OSW2YLR054C 2175 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 MCH1YDL054C 1461 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 EXG1YLR300W 1347 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 VPS4YPR173C 1314 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 RAD59YDL059C 717 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 YGL235WYGL235W 537 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 GLC8YMR311C 690 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 PAP2YOL115W 1755 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 PTK2YJR059W 2457 nt5.33□□□□□ -1.56
UFD1P53044 GFA1YKL104C 2154 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 MNN5YJL186W 1761 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 FYV1YDR024W 486 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 YDR187CYDR187C 519 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 YJL171CYJL171C 1191 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 TDH2YJR009C 999 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 NPA3YJR072C 1158 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 EFM3YJR129C 1020 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 DAP1YPL170W 459 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 IFA38YBR159W 1044 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 SET5YHR207C 1581 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 AAP1YHR047C 2571 nt5.32□□□□□ -1.56
UFD1P53044 ILV1YER086W 1731 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 YTP1YNL237W 1380 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 RPL7AYGL076C 735 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 AAT2YLR027C 1257 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 RPL7BYPL198W 735 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 TAE1YBR261C 699 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 DBP9YLR276C 1785 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 CDC1YDR182W 1476 nt5.31□□□□□ -1.56
UFD1P53044 YCK1YHR135C 1617 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 PET112YBL080C 1626 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 TEP1YNL128W 1305 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 EHD3YDR036C 1503 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 CNE1YAL058W 1509 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 SDH4YDR178W 546 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 YLR296WYLR296W 327 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 ODC2YOR222W 924 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 VPS70YJR126C 2436 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 RRP9YPR137W 1722 nt5.3□□□□□ -1.56
UFD1P53044 VPS1YKR001C 2115 nt5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms