Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV2P52735 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV2P52735 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV2P52735 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV2P52735 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV2P52735 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV2P52735 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV2P52735 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV2P52735 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV2P52735 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV2P52735 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV2P52735 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV2P52735 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV2P52735 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAV2P52735 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAV2P52735 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV2P52735 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV2P52735 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV2P52735 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV2P52735 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV2P52735 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV2P52735 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV2P52735 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV2P52735 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV2P52735 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV2P52735 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV2P52735 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV2P52735 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV2P52735 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV2P52735 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV2P52735 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV2P52735 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV2P52735 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV2P52735 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV2P52735 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV2P52735 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV2P52735 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV2P52735 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV2P52735 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV2P52735 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV2P52735 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV2P52735 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV2P52735 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV2P52735 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV2P52735 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV2P52735 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VAV2P52735 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VAV2P52735 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV2P52735 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV2P52735 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV2P52735 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV2P52735 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV2P52735 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV2P52735 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms