Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DAP3P51398 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DAP3P51398 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DAP3P51398 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DAP3P51398 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DAP3P51398 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DAP3P51398 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DAP3P51398 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DAP3P51398 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DAP3P51398 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DAP3P51398 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DAP3P51398 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DAP3P51398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DAP3P51398 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DAP3P51398 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DAP3P51398 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DAP3P51398 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DAP3P51398 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DAP3P51398 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DAP3P51398 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DAP3P51398 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DAP3P51398 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DAP3P51398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DAP3P51398 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DAP3P51398 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DAP3P51398 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DAP3P51398 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DAP3P51398 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DAP3P51398 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DAP3P51398 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DAP3P51398 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DAP3P51398 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DAP3P51398 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DAP3P51398 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DAP3P51398 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DAP3P51398 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DAP3P51398 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DAP3P51398 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DAP3P51398 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DAP3P51398 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DAP3P51398 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DAP3P51398 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DAP3P51398 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DAP3P51398 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DAP3P51398 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DAP3P51398 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DAP3P51398 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DAP3P51398 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DAP3P51398 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DAP3P51398 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DAP3P51398 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DAP3P51398 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DAP3P51398 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DAP3P51398 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DAP3P51398 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DAP3P51398 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DAP3P51398 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DAP3P51398 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DAP3P51398 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DAP3P51398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DAP3P51398 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms