Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX2P40425 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX2P40425 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX2P40425 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX2P40425 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX2P40425 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX2P40425 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX2P40425 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX2P40425 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX2P40425 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX2P40425 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX2P40425 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX2P40425 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX2P40425 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX2P40425 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX2P40425 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX2P40425 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX2P40425 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX2P40425 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX2P40425 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX2P40425 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX2P40425 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX2P40425 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX2P40425 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX2P40425 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX2P40425 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PBX2P40425 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX2P40425 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX2P40425 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX2P40425 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX2P40425 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX2P40425 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX2P40425 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX2P40425 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX2P40425 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX2P40425 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX2P40425 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX2P40425 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX2P40425 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX2P40425 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX2P40425 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX2P40425 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX2P40425 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX2P40425 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX2P40425 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX2P40425 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX2P40425 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX2P40425 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX2P40425 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PBX2P40425 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX2P40425 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX2P40425 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX2P40425 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX2P40425 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX2P40425 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX2P40425 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX2P40425 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX2P40425 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBX2P40425 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBX2P40425 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PBX2P40425 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX2P40425 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX2P40425 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms