Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 GEX2YKR106W 1848 nt5.74□□□□□ -1.49
DDI1P40087 RPE1YJL121C 717 nt5.73□□□□□ -1.49
DDI1P40087 DBP9YLR276C 1785 nt5.72□□□□□ -1.49
DDI1P40087 RNR3YIL066C 2610 nt5.72□□□□□ -1.49
DDI1P40087 CCT8YJL008C 1707 nt5.72□□□□□ -1.49
DDI1P40087 CHS5YLR330W 2016 nt5.72□□□□□ -1.49
DDI1P40087 RIX7YLL034C 2514 nt5.72□□□□□ -1.49
DDI1P40087 SFB3YHR098C 2790 nt5.72□□□□□ -1.49
DDI1P40087 CMR1YDL156W 1569 nt5.72□□□□□ -1.49
DDI1P40087 ALT1YLR089C 1779 nt5.71□□□□□ -1.5
DDI1P40087 GTO3YMR251W 1101 nt5.7□□□□□ -1.5
DDI1P40087 CPA1YOR303W 1236 nt5.7□□□□□ -1.5
DDI1P40087 TNA1YGR260W 1605 nt5.7□□□□□ -1.5
DDI1P40087 KEX2YNL238W 2445 nt5.69□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SRL2YLR082C 1179 nt5.69□□□□□ -1.5
DDI1P40087 DAP1YPL170W 459 nt5.69□□□□□ -1.5
DDI1P40087 CST6YIL036W 1764 nt5.69□□□□□ -1.5
DDI1P40087 COX15YER141W 1461 nt5.69□□□□□ -1.5
DDI1P40087 CWC21YDR482C 408 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 BCY1YIL033C 1251 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 RPL10YLR075W 666 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 MSO1YNR049C 633 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 GAA1YLR088W 1845 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 ROG3YFR022W 2202 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 ILV1YER086W 1731 nt5.68□□□□□ -1.5
DDI1P40087 YTP1YNL237W 1380 nt5.67□□□□□ -1.5
DDI1P40087 PYC2YBR218C 3543 nt5.67□□□□□ -1.5
DDI1P40087 AMD2YDR242W 1650 nt5.67□□□□□ -1.5
DDI1P40087 TIM22YDL217C 624 nt5.67□□□□□ -1.5
DDI1P40087 NPA3YJR072C 1158 nt5.67□□□□□ -1.5
DDI1P40087 PTC4YBR125C 1182 nt5.67□□□□□ -1.5
DDI1P40087 GAT1YFL021W 1533 nt5.67□□□□□ -1.5
DDI1P40087 DUG1YFR044C 1446 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 RPN7YPR108W 1290 nt5.66□□□□□ -1.5
DDI1P40087 CLB1YGR108W 1416 nt5.65□□□□□ -1.5
DDI1P40087 BUG1YDL099W 1026 nt5.65□□□□□ -1.5
DDI1P40087 RPS3YNL178W 723 nt5.65□□□□□ -1.5
DDI1P40087 SPE3YPR069C 882 nt5.65□□□□□ -1.5
DDI1P40087 MCH1YDL054C 1461 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 GUD1YDL238C 1470 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YCK1YHR135C 1617 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 COX20YDR231C 618 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 CHO1YER026C 831 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 FAF1YIL019W 1041 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 ASF1YJL115W 840 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YLR296WYLR296W 327 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 LGE1YPL055C 999 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 FAT3YKL187C 2253 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 FLC3YGL139W 2409 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 CRH1YGR189C 1524 nt5.64□□□□□ -1.51
DDI1P40087 JIP4YDR475C 2631 nt5.63□□□□□ -1.51
DDI1P40087 FMO1YHR176W 1299 nt5.63□□□□□ -1.51
DDI1P40087 HOC1YJR075W 1191 nt5.63□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YNR040WYNR040W 771 nt5.63□□□□□ -1.51
DDI1P40087 MCP1YOR228C 909 nt5.63□□□□□ -1.51
DDI1P40087 HST3YOR025W 1344 nt5.63□□□□□ -1.51
DDI1P40087 PTC3YBL056W 1407 nt5.63□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YLL067CYLL067C 3618 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YKL223WYKL223W 333 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 ZIM17YNL310C 525 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 AAD14YNL331C 1131 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YOL131WYOL131W 327 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 OXP1YKL215C 3861 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 MAL11YGR289C 1851 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YAP1801YHR161C 1914 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 EPS1YIL005W 2106 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 GSY2YLR258W 2118 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 KKQ8YKL168C 2175 nt5.62□□□□□ -1.51
DDI1P40087 TRP5YGL026C 2124 nt5.61□□□□□ -1.51
DDI1P40087 LSC1YOR142W 990 nt5.61□□□□□ -1.51
DDI1P40087 TFC6YDR362C 2019 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 ELP3YPL086C 1674 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 UBA1YKL210W 3075 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 FRS2YFL022C 1512 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 RPN11YFR004W 921 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 LIA1YJR070C 978 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 CDC11YJR076C 1248 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YJR084WYJR084W 1272 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 YKL153WYKL153W 510 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 FPR3YML074C 1236 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 MSN2YMR037C 2115 nt5.6□□□□□ -1.51
DDI1P40087 WHI2YOR043W 1461 nt5.59□□□□□ -1.51
DDI1P40087 TAF9YMR236W 474 nt5.59□□□□□ -1.51
DDI1P40087 SCO2YBR024W 906 nt5.59□□□□□ -1.51
DDI1P40087 RRS1YOR294W 612 nt5.59□□□□□ -1.51
DDI1P40087 GUA1YMR217W 1578 nt5.59□□□□□ -1.52
DDI1P40087 TKL1YPR074C 2043 nt5.58□□□□□ -1.52
DDI1P40087 RMA1YKL132C 1293 nt5.58□□□□□ -1.52
DDI1P40087 PFA3YNL326C 1011 nt5.58□□□□□ -1.52
DDI1P40087 VBA1YMR088C 1689 nt5.58□□□□□ -1.52
DDI1P40087 PLB3YOL011W 2061 nt5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms