Protein–RNA interactions for Protein: P36000

APL2, AP-1 complex subunit beta-1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL2P36000 COX20YDR231C 618 nt7.44□□□□□ -1.22
APL2P36000 YMC1YPR058W 924 nt7.44□□□□□ -1.22
APL2P36000 TOS2YGR221C 1869 nt7.44□□□□□ -1.22
APL2P36000 YCK1YHR135C 1617 nt7.44□□□□□ -1.22
APL2P36000 COR1YBL045C 1374 nt7.44□□□□□ -1.22
APL2P36000 BUD9YGR041W 1644 nt7.43□□□□□ -1.22
APL2P36000 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.43□□□□□ -1.22
APL2P36000 LDS1YAL018C 978 nt7.43□□□□□ -1.22
APL2P36000 EEB1YPL095C 1371 nt7.43□□□□□ -1.22
APL2P36000 YPR204WYPR204W 3099 nt7.42□□□□□ -1.22
APL2P36000 YJL211CYJL211C 444 nt7.42□□□□□ -1.22
APL2P36000 SRN2YLR119W 642 nt7.42□□□□□ -1.22
APL2P36000 PEX13YLR191W 1161 nt7.42□□□□□ -1.22
APL2P36000 YML012C-AYML012C-A 378 nt7.42□□□□□ -1.22
APL2P36000 IES2YNL215W 963 nt7.42□□□□□ -1.22
APL2P36000 SRF1YDL133W 1314 nt7.42□□□□□ -1.22
APL2P36000 YDL129WYDL129W 876 nt7.41□□□□□ -1.22
APL2P36000 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.4□□□□□ -1.22
APL2P36000 POP5YAL033W 522 nt7.4□□□□□ -1.22
APL2P36000 OPI8YKR035C 642 nt7.4□□□□□ -1.22
APL2P36000 SSP120YLR250W 705 nt7.4□□□□□ -1.22
APL2P36000 CIN4YMR138W 576 nt7.4□□□□□ -1.22
APL2P36000 EXG1YLR300W 1347 nt7.4□□□□□ -1.22
APL2P36000 GEF1YJR040W 2340 nt7.39□□□□□ -1.23
APL2P36000 HSM3YBR272C 1443 nt7.39□□□□□ -1.23
APL2P36000 RPN11YFR004W 921 nt7.39□□□□□ -1.23
APL2P36000 MRPS16YPL013C 366 nt7.39□□□□□ -1.23
APL2P36000 PRP2YNR011C 2631 nt7.39□□□□□ -1.23
APL2P36000 PYK2YOR347C 1521 nt7.38□□□□□ -1.23
APL2P36000 WHI2YOR043W 1461 nt7.38□□□□□ -1.23
APL2P36000 MTC2YKL098W 1074 nt7.38□□□□□ -1.23
APL2P36000 COX5AYNL052W 462 nt7.38□□□□□ -1.23
APL2P36000 MRPS12YNR036C 462 nt7.38□□□□□ -1.23
APL2P36000 ATG12YBR217W 561 nt7.38□□□□□ -1.23
APL2P36000 NSE5YML023C 1671 nt7.38□□□□□ -1.23
APL2P36000 YEL068CYEL068C 333 nt7.37□□□□□ -1.23
APL2P36000 RPE1YJL121C 717 nt7.37□□□□□ -1.23
APL2P36000 PXL1YKR090W 2121 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 CHS5YLR330W 2016 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 snR82snR82 268 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 FZF1YGL254W 900 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 SNO4YMR322C 714 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 HSP33YOR391C 714 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 HSP32YPL280W 714 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 TPO3YPR156C 1869 nt7.36□□□□□ -1.23
APL2P36000 YIR042CYIR042C 711 nt7.35□□□□□ -1.23
APL2P36000 YPL071CYPL071C 471 nt7.35□□□□□ -1.23
APL2P36000 LEU5YHR002W 1074 nt7.34□□□□□ -1.23
APL2P36000 TSA1YML028W 591 nt7.34□□□□□ -1.23
APL2P36000 YPR114WYPR114W 948 nt7.34□□□□□ -1.23
APL2P36000 MRPS5YBR251W 924 nt7.34□□□□□ -1.23
APL2P36000 ACO1YLR304C 2337 nt7.34□□□□□ -1.23
APL2P36000 PRI2YKL045W 1587 nt7.33□□□□□ -1.24
APL2P36000 ATF1YOR377W 1578 nt7.33□□□□□ -1.24
APL2P36000 ELP3YPL086C 1674 nt7.33□□□□□ -1.24
APL2P36000 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.33□□□□□ -1.24
APL2P36000 PHB1YGR132C 864 nt7.33□□□□□ -1.24
APL2P36000 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.33□□□□□ -1.24
APL2P36000 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.33□□□□□ -1.24
APL2P36000 CDC19YAL038W 1503 nt7.32□□□□□ -1.24
APL2P36000 RAD24YER173W 1980 nt7.32□□□□□ -1.24
APL2P36000 SPS22YCL048W 1392 nt7.32□□□□□ -1.24
APL2P36000 MRK1YDL079C 1506 nt7.32□□□□□ -1.24
APL2P36000 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 PGM1YKL127W 1713 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 AIM3YBR108W 2844 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 SES1YDR023W 1389 nt7.31□□□□□ -1.24
APL2P36000 RPR2YIR015W 435 nt7.3□□□□□ -1.24
APL2P36000 PZF1YPR186C 1290 nt7.3□□□□□ -1.24
APL2P36000 RPL21AYBR191W 483 nt7.3□□□□□ -1.24
APL2P36000 FET4YMR319C 1659 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 YDL119CYDL119C 924 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 TRR1YDR353W 960 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 COA1YIL157C 594 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 AIM33YML087C 939 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 UBC11YOR339C 471 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 DAP1YPL170W 459 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 MPA43YNL249C 1629 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 GUD1YDL238C 1470 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 PUF3YLL013C 2640 nt7.29□□□□□ -1.24
APL2P36000 EDC3YEL015W 1656 nt7.28□□□□□ -1.24
APL2P36000 AGP2YBR132C 1791 nt7.28□□□□□ -1.24
APL2P36000 AFG1YEL052W 1530 nt7.28□□□□□ -1.24
APL2P36000 YFR006WYFR006W 1608 nt7.28□□□□□ -1.24
APL2P36000 HSP12YFL014W 330 nt7.28□□□□□ -1.24
APL2P36000 RPL10YLR075W 666 nt7.28□□□□□ -1.24
APL2P36000 AAD15YOL165C 432 nt7.28□□□□□ -1.24
APL2P36000 CMR1YDL156W 1569 nt7.27□□□□□ -1.25
APL2P36000 PPS1YBR276C 2424 nt7.27□□□□□ -1.25
APL2P36000 TFC6YDR362C 2019 nt7.27□□□□□ -1.25
APL2P36000 HST3YOR025W 1344 nt7.27□□□□□ -1.25
APL2P36000 YFL052WYFL052W 1398 nt7.26□□□□□ -1.25
APL2P36000 RHB1YCR027C 630 nt7.26□□□□□ -1.25
APL2P36000 HAP3YBL021C 435 nt7.26□□□□□ -1.25
APL2P36000 ELA1YNL230C 1140 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 750 ms