Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A2P23975 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A2P23975 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms