Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFYAP23511 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFYAP23511 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFYAP23511 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFYAP23511 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFYAP23511 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFYAP23511 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFYAP23511 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFYAP23511 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFYAP23511 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFYAP23511 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFYAP23511 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFYAP23511 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFYAP23511 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFYAP23511 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFYAP23511 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFYAP23511 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFYAP23511 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFYAP23511 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFYAP23511 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFYAP23511 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFYAP23511 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFYAP23511 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFYAP23511 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFYAP23511 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFYAP23511 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFYAP23511 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFYAP23511 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFYAP23511 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFYAP23511 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFYAP23511 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFYAP23511 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFYAP23511 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFYAP23511 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFYAP23511 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFYAP23511 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFYAP23511 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFYAP23511 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFYAP23511 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFYAP23511 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFYAP23511 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFYAP23511 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFYAP23511 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFYAP23511 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFYAP23511 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFYAP23511 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFYAP23511 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFYAP23511 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFYAP23511 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms