Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMNB1P20700 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNB1P20700 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms