Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6AP20340 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 408.8 ms