Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT4P19013 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT4P19013 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT4P19013 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT4P19013 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT4P19013 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT4P19013 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT4P19013 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT4P19013 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT4P19013 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT4P19013 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT4P19013 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT4P19013 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT4P19013 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT4P19013 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT4P19013 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT4P19013 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT4P19013 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT4P19013 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT4P19013 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT4P19013 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT4P19013 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT4P19013 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT4P19013 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT4P19013 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT4P19013 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT4P19013 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT4P19013 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT4P19013 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT4P19013 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT4P19013 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT4P19013 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms