Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATF3P18847 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATF3P18847 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATF3P18847 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATF3P18847 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATF3P18847 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATF3P18847 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATF3P18847 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATF3P18847 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ATF3P18847 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ATF3P18847 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATF3P18847 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATF3P18847 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATF3P18847 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ATF3P18847 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATF3P18847 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ATF3P18847 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ATF3P18847 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATF3P18847 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATF3P18847 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ATF3P18847 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ATF3P18847 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATF3P18847 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATF3P18847 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
ATF3P18847 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATF3P18847 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATF3P18847 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ATF3P18847 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ATF3P18847 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ATF3P18847 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATF3P18847 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATF3P18847 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATF3P18847 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATF3P18847 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATF3P18847 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATF3P18847 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATF3P18847 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATF3P18847 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATF3P18847 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATF3P18847 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATF3P18847 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATF3P18847 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ATF3P18847 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ATF3P18847 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATF3P18847 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATF3P18847 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATF3P18847 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ATF3P18847 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATF3P18847 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATF3P18847 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATF3P18847 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATF3P18847 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATF3P18847 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATF3P18847 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATF3P18847 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATF3P18847 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATF3P18847 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATF3P18847 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATF3P18847 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATF3P18847 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATF3P18847 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF3P18847 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF3P18847 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF3P18847 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF3P18847 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF3P18847 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF3P18847 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATF3P18847 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATF3P18847 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATF3P18847 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATF3P18847 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATF3P18847 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATF3P18847 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATF3P18847 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATF3P18847 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATF3P18847 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ATF3P18847 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATF3P18847 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF3P18847 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF3P18847 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF3P18847 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF3P18847 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF3P18847 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF3P18847 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF3P18847 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF3P18847 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF3P18847 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF3P18847 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF3P18847 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF3P18847 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF3P18847 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF3P18847 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms