Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLUP10909 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLUP10909 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLUP10909 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLUP10909 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLUP10909 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLUP10909 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLUP10909 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLUP10909 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLUP10909 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLUP10909 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLUP10909 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLUP10909 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLUP10909 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLUP10909 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLUP10909 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLUP10909 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLUP10909 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLUP10909 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLUP10909 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLUP10909 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLUP10909 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLUP10909 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLUP10909 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLUP10909 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLUP10909 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLUP10909 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLUP10909 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLUP10909 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLUP10909 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLUP10909 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLUP10909 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLUP10909 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLUP10909 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLUP10909 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLUP10909 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLUP10909 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLUP10909 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLUP10909 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLUP10909 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLUP10909 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLUP10909 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLUP10909 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLUP10909 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLUP10909 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLUP10909 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLUP10909 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLUP10909 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLUP10909 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLUP10909 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLUP10909 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLUP10909 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLUP10909 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLUP10909 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms