Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG8P0DPA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG8P0DPA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms