Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP9P0CG40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SP9P0CG40 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SP9P0CG40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP9P0CG40 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.9 ms