Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR35P0CG20 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms