Protein–RNA interactions for Protein: P08514

ITGA2B, Integrin alpha-IIb, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2BP08514 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA2BP08514 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2BP08514 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2BP08514 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2BP08514 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2BP08514 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2BP08514 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2BP08514 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2BP08514 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2BP08514 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms