Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SERPINC1P01008 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SERPINC1P01008 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SERPINC1P01008 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms