Protein–RNA interactions for Protein: O94850

DDN, Dendrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDNO94850 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDNO94850 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDNO94850 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDNO94850 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDNO94850 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDNO94850 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DDNO94850 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDNO94850 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDNO94850 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDNO94850 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DDNO94850 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDNO94850 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDNO94850 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DDNO94850 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDNO94850 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDNO94850 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDNO94850 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDNO94850 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDNO94850 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDNO94850 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDNO94850 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDNO94850 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDNO94850 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDNO94850 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDNO94850 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDNO94850 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDNO94850 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDNO94850 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDNO94850 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DDNO94850 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DDNO94850 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DDNO94850 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DDNO94850 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDNO94850 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDNO94850 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDNO94850 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDNO94850 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDNO94850 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDNO94850 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DDNO94850 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDNO94850 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDNO94850 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDNO94850 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDNO94850 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDNO94850 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDNO94850 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDNO94850 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDNO94850 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDNO94850 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDNO94850 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDNO94850 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDNO94850 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDNO94850 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDNO94850 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDNO94850 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDNO94850 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDNO94850 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDNO94850 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDNO94850 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDNO94850 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDNO94850 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDNO94850 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDNO94850 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDNO94850 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDNO94850 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDNO94850 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDNO94850 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDNO94850 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDNO94850 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDNO94850 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDNO94850 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDNO94850 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DDNO94850 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDNO94850 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDNO94850 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDNO94850 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDNO94850 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DDNO94850 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDNO94850 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDNO94850 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDNO94850 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDNO94850 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDNO94850 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDNO94850 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDNO94850 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDNO94850 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDNO94850 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDNO94850 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDNO94850 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDNO94850 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDNO94850 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDNO94850 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDNO94850 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDNO94850 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDNO94850 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDNO94850 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDNO94850 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DDNO94850 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDNO94850 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDNO94850 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms