Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX11O75558 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX11O75558 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX11O75558 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX11O75558 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX11O75558 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX11O75558 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX11O75558 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX11O75558 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX11O75558 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX11O75558 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX11O75558 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX11O75558 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX11O75558 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX11O75558 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX11O75558 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX11O75558 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX11O75558 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX11O75558 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX11O75558 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX11O75558 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX11O75558 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX11O75558 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX11O75558 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX11O75558 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX11O75558 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX11O75558 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX11O75558 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX11O75558 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX11O75558 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX11O75558 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX11O75558 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX11O75558 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX11O75558 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX11O75558 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX11O75558 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX11O75558 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX11O75558 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX11O75558 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX11O75558 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX11O75558 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX11O75558 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX11O75558 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX11O75558 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX11O75558 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX11O75558 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STX11O75558 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX11O75558 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX11O75558 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX11O75558 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX11O75558 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX11O75558 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX11O75558 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms