Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR1O43759 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR1O43759 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms